5月16日入川后，侯永全负责医疗队梓潼医疗救助站后勤保障工作，每天冒着余震的危险，全力为队员们改善吃住条件。建站初期，环境极差，他主动担当起巡查诊所和周围环境的卫生防疫任务，很快使该站环境整洁、面貌一新，伤员得到 有效救治。 5月27日上午，为救治来自映秀镇的一名重伤员，他主动抬担架护送伤员到四川武警总院，整个转救延续了10个小时，直到伤员被妥善安置。

他在深入损失最重的北川地区执行任务时，冒着山体滑坡和可能出现疫情的危险。期间，曾和突击队成员一度突然失去联系，这时恰巧发生余震，但他全然不顾，坚守工作岗位。

后期，他负责医疗基地医院后勤保障、医疗队每天情况的分析、统计、上报，辅助领导决策。灾区通讯网络信号不好，他通过各种手段确保国网公司、省公司指挥部及时准确掌握灾区一线救治情况，每天仅休息2到3个小时，甚至是整夜忙碌。为了规范医疗救治工作，他在领队的直接指导下，高效利用一天一夜的时间，搜集资料、排版、赶印了《抗震救灾队员手册》，有效指导了震区救灾和医疗防疫工作。